Ubuntu10.10配置R環(huán)境的方法(2)

　　整體分為三部分進(jìn)行管理:

　　1. R本身 和一些庫(kù) 用 apt-get 進(jìn)行更新

　　2. 官方推薦包 默認(rèn)存在于 /usr/lib/R/library 可用管理員權(quán)限下的 update.packages() 更新

　　3. 用戶安裝包 默認(rèn)存在于 /usr/lib/R/site-library 可用管理員權(quán)限下的 update.packages() 更新

　　如果用非管理員的用戶去裝包, 會(huì)裝到另外一個(gè)新文件夾中. 因?yàn)閷?duì)以上目錄沒有寫權(quán)限.

　　如果用非管理員權(quán)限裝包, 會(huì)裝到另外一個(gè)新文件夾中. 因?yàn)閷?duì)以上目錄沒有寫權(quán)限. 用管理員權(quán)限會(huì)默認(rèn)裝到 /usr/local/lib/R/site-library 里. 更新的時(shí)候亦然.

　　sudo gedit /etc/R/Rprofile.site # 修改默認(rèn)CRAN鏡像

　　手工安裝依賴了特別庫(kù)的包

　　安裝程序包'Cairo'時(shí)退出狀態(tài)的值不為0

　　安裝程序包'rgl'時(shí)退出狀態(tài)的值不為0

　　安裝程序包'XML'時(shí)退出狀態(tài)的值不為0:

　　安裝程序包'RCurl'時(shí)退出狀態(tài)的值不為0

　　安裝程序包'cairoDevice'時(shí)退出狀態(tài)的值不為0

　　安裝程序包'fftw'時(shí)退出狀態(tài)的值不為0

　　安裝程序包'rcdd'時(shí)退出狀態(tài)的值不為0

　　安裝程序包'rgdal'時(shí)退出狀態(tài)的值不為0

　　依賴rgl引起的:

　　installation of package 'ks' had non-zero exit status

　　installation of package 'feature' had non-zero exit status

　　installation of package 'flowCore' had non-zero exit status

　　installation of package 'flowViz' had non-zero exit status